Sekolah Tinggi Teologi (STT) Ekumene Jakarta secara rutin menyelenggarakan kegiatan Audit Mutu Internal (AMI) sebagai bagian dari komitmen untuk menjaga dan meningkatkan kualitas pendidikan teologi yang unggul, berlandaskan kebenaran Alkitab, dan selaras dengan semangat nasionalisme Negara Kesatuan Republik Indonesia. Kegiatan AMI ini dirancang untuk memastikan bahwa setiap aspek penyelenggaraan pendidikan, mulai dari kurikulum, proses pembelajaran, hingga pengabdian masyarakat, memenuhi standar akreditasi yang ditetapkan oleh Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT).

Pada pelaksanaan AMI terbaru, STT Ekumene Jakarta melibatkan berbagai pemangku kepentingan, termasuk mahasiswa, dosen, dan pengurus yayasan, untuk mengevaluasi efektivitas program studi seperti Sarjana Pendidikan Agama Kristen (S1 PAK) dan Sarjana Teologi (S1 Teologi) Kegiatan ini mencakup penilaian terhadap fasilitas pendidikan, seperti yang berlokasi di Mall Artha Gading, Jakarta Utara, serta review terhadap capaian penelitian dan pengabdian masyarakat yang dilakukan oleh Lembaga Penelitian dan Pengabdian Masyarakat (LPPM) STT Ekumene.

Salah satu sorotan dalam kegiatan AMI adalah kolaborasi yang erat antara dosen dan mahasiswa dalam mengkaji relevansi kurikulum dengan kebutuhan gereja dan masyarakat. Diskusi intensif dilakukan untuk memastikan bahwa lulusan STT Ekumene tidak hanya memiliki pengetahuan teologi yang mendalam, tetapi juga mampu mengaplikasikan nilai-nilai Kristen dalam kehidupan sosial yang majemuk. Selain itu, AMI juga mengevaluasi kegiatan pengabdian masyarakat, seperti kunjungan ke Panti Asuhan Pintu Elok di Tangerang Selatan pada 29 Maret 2025, yang melibatkan mahasiswa dan alumni dalam aksi nyata untuk menunjukkan kasih dan pelayanan kepada sesama.

Melalui kegiatan AMI, STT Ekumene Jakarta terus berupaya memperkuat visinya sebagai institusi pendidikan teologi yang unggul, menghasilkan sarjana teologi yang tidak hanya kompeten secara akademik, tetapi juga mampu menjadi teladan dalam kehidupan beriman dan bermasyarakat. Kegiatan ini menjadi wujud nyata dari dedikasi STT Ekumene untuk mendukung pelayanan gereja dan memajukan pendidikan Kristen di Indonesia.